Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Olfr1120-201ENSMUST00000058737 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox12Q04890 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms