Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mc1rQ01727 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms