Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin2bQ01097 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin2bQ01097 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms