Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Apoa1Q00623 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms