Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pax8Q00288 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms