Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Taf1bP97358 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Taf1bP97358 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Taf1bP97358 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Taf1bP97358 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Taf1bP97358 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Taf1bP97358 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Taf1bP97358 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Taf1bP97358 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Taf1bP97358 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Taf1bP97358 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Taf1bP97358 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Taf1bP97358 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Taf1bP97358 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Taf1bP97358 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Taf1bP97358 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Taf1bP97358 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Taf1bP97358 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf1bP97358 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms