Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XpcP51612 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XpcP51612 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XpcP51612 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XpcP51612 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XpcP51612 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
XpcP51612 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
XpcP51612 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
XpcP51612 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
XpcP51612 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
XpcP51612 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
XpcP51612 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
XpcP51612 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
XpcP51612 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XpcP51612 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
XpcP51612 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XpcP51612 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
XpcP51612 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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