Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TspoP50637 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TspoP50637 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TspoP50637 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TspoP50637 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TspoP50637 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TspoP50637 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TspoP50637 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
TspoP50637 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TspoP50637 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TspoP50637 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TspoP50637 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TspoP50637 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TspoP50637 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TspoP50637 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TspoP50637 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TspoP50637 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TspoP50637 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TspoP50637 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TspoP50637 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TspoP50637 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms