Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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