Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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PtpreP49446 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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PtpreP49446 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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PtpreP49446 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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PtpreP49446 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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PtpreP49446 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms