Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
VdrP48281 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
VdrP48281 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms