Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrprbP47758 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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