Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TtlP38585 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TtlP38585 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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TtlP38585 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TtlP38585 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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