Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PpargP37238 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PpargP37238 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PpargP37238 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PpargP37238 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PpargP37238 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PpargP37238 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PpargP37238 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PpargP37238 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PpargP37238 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PpargP37238 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PpargP37238 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms