Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxrgP28705 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms