Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PdgfraP26618 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PdgfraP26618 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PdgfraP26618 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms