Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RdxP26043 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RdxP26043 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RdxP26043 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RdxP26043 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RdxP26043 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RdxP26043 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RdxP26043 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RdxP26043 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RdxP26043 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RdxP26043 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RdxP26043 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RdxP26043 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RdxP26043 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RdxP26043 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RdxP26043 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RdxP26043 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RdxP26043 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RdxP26043 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RdxP26043 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms