Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ggta1P23336 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms