Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PrkchP23298 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PrkchP23298 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms