Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prim1P20664 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prim1P20664 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prim1P20664 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prim1P20664 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prim1P20664 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prim1P20664 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms