Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TP20293 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TP20293 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TP20293 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TP20293 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TP20293 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TP20293 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TP20293 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TP20293 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TP20293 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TP20293 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TP20293 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TP20293 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TP20293 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TP20293 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TP20293 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TP20293 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
TP20293 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TP20293 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TP20293 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TP20293 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TP20293 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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