Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
P20040 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
P20040 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
P20040 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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