Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18533 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18533 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18533 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms