Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms