Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm37608-201ENSMUST00000195696 1880 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb1P13372 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms