Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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DmdP11531 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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DmdP11531 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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DmdP11531 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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DmdP11531 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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DmdP11531 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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DmdP11531 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DmdP11531 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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DmdP11531 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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DmdP11531 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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DmdP11531 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DmdP11531 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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DmdP11531 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DmdP11531 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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DmdP11531 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DmdP11531 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
DmdP11531 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
DmdP11531 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
DmdP11531 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
DmdP11531 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
DmdP11531 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
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DmdP11531 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
DmdP11531 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms