Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P10404 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P10404 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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