Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BlmO88700 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BlmO88700 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BlmO88700 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BlmO88700 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BlmO88700 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BlmO88700 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BlmO88700 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BlmO88700 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BlmO88700 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BlmO88700 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BlmO88700 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BlmO88700 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BlmO88700 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BlmO88700 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BlmO88700 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BlmO88700 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BlmO88700 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BlmO88700 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BlmO88700 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BlmO88700 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
BlmO88700 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BlmO88700 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BlmO88700 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BlmO88700 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BlmO88700 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BlmO88700 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BlmO88700 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BlmO88700 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BlmO88700 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BlmO88700 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BlmO88700 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BlmO88700 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BlmO88700 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BlmO88700 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BlmO88700 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BlmO88700 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BlmO88700 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BlmO88700 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BlmO88700 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BlmO88700 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BlmO88700 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BlmO88700 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms