Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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BckdkO55028 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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BckdkO55028 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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BckdkO55028 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
BckdkO55028 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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