Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
DffaO54786 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
DffaO54786 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
DffaO54786 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
DffaO54786 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
DffaO54786 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DffaO54786 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms