Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc27a2O35488 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc27a2O35488 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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