Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dgcr6O35347 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms