Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MttpO08601 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MttpO08601 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
MttpO08601 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MttpO08601 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MttpO08601 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MttpO08601 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MttpO08601 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
MttpO08601 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
MttpO08601 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms