Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Gm17078M0QW51 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17078M0QW51 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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