Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gm20795J3QP49 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms