Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Smim22J3QP37 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms