Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem200cJ3QK46 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms