Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
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