Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Vmn1r167G3UW71 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Vmn1r167G3UW71 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Vmn1r167G3UW71 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Vmn1r167G3UW71 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vmn1r167G3UW71 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Vmn1r167G3UW71 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Vmn1r167G3UW71 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Vmn1r167G3UW71 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Vmn1r167G3UW71 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Vmn1r167G3UW71 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Vmn1r167G3UW71 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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