Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms