Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ScaperF8VQ70 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScaperF8VQ70 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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