Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fndc1E9Q043 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Fndc1E9Q043 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 486 ms