Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms