Protein–RNA interactions for Protein: D3YZU1

Shank1, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank1D3YZU1 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shank1D3YZU1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shank1D3YZU1 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shank1D3YZU1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shank1D3YZU1 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shank1D3YZU1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shank1D3YZU1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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