Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Phf11cB4XVP9 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Phf11cB4XVP9 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms