Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PtprbB2RU80 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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