Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H60cB1B213 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H60cB1B213 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H60cB1B213 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
H60cB1B213 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms