Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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Trabd2bB1ATG9 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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Trabd2bB1ATG9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Trabd2bB1ATG9 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Trabd2bB1ATG9 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Trabd2bB1ATG9 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Trabd2bB1ATG9 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trabd2bB1ATG9 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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