Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Samt1A2BED8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Samt1A2BED8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Samt1A2BED8 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Samt1A2BED8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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