Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rtf1A2AQ19 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms